Die Fachkommissionen analysieren vertieft Themen aus den jeweiligen Fachbereichen und bereiten Anträge zu Handen des Stiftungsrates vor. Die Fachkommissionen sind nicht paritätisch zusammengesetzt; im Vordergrund steht die fachliche Qualifikation der Mitglieder.
| Finanzen | Immobilien | Reglemente | Personal |
| M. Rüegsegger (P) | D. Lack (P) | A. Widrig (P) | R. Frey (P) |
| R. Frey | W. Binz | R. Frey | M. Rüegsegger |
| R. Howald | R. Frey | K. Neuenschwander | H. Zimmermann |
| E. von Winterfeld | R. Gross | R. Müller-Hausherr | R. Müller-Hausherr |
| H. Zimmermann | |||
| R. Zaugg* | R. Zaugg* | R. Zaugg* | R. Zaugg* |
| W. Guntern* | M. Zingg* | W. Guntern* | |
| W. Guntern* |
* ohne Stimmrecht