Die Fachkommissionen analysieren vertieft Themen aus den jeweiligen Fachbereichen und bereiten Anträge zu Handen des Stiftungsrates vor. Die Fachkommissionen sind nicht paritätisch zusammengesetzt; im Vordergrund steht die fachliche Qualifikation der Mitglieder.
| Finanzen | Immobilien | Reglemente | Personal |
| M. Rüegsegger (P) | D. Lack (P) | A. Widrig (P) | R. Frey (P) |
| F. Diener | R. Frey | R. Frey | R. Müller-Hausherr |
| R. Frey | R. Gross | K. Neuenschwander | M. Rüegsegger (VP) |
| R. Howald | J. Schweizer | R. Müller-Hausherr | H. Zimmermann |
| E. von Winterfeld | H. Zimmermann | ||
| W. Guntern* | W. Guntern* | W. Guntern* | W. Guntern* |
| M. Zingg* | R. Zaugg* | ||
* ohne Stimmrecht